首次注冊申請：注冊申請人向國家食品藥品監(jiān)督管理總局提出境內第三類、進口第二類和第三類醫(yī)療器械產(chǎn)品首次注冊申請，國家食品藥品監(jiān)督管理總局受理后出具《行政許可項目繳費通知書》，注冊申請人應當按要求繳納。
變更注冊申請：注冊申請人向國家食品藥品監(jiān)督管理總局提出境內第三類、進口第二類和第三類醫(yī)療器械產(chǎn)品許可事項變更注冊申請，國家食品藥品監(jiān)督管理總局受理后出具《行政許可項目繳費通知書》，注冊申請人應當按要求繳納。需要注意的是，《醫(yī)療器械注冊管理辦法》、《體外診斷試劑注冊管理辦法》中屬于注冊登記事項變更的，不收取變更注冊申請費用。
延續(xù)注冊申請：注冊申請人向國家食品藥品監(jiān)督管理總局提出境內第三類、進口第二類和第三類醫(yī)療器械產(chǎn)品延續(xù)注冊申請，國家食品藥品監(jiān)督管理總局受理后出具《行政許可項目繳費通知書》，注冊申請人應當按要求繳納。
臨床試驗申請：醫(yī)療器械注冊申請人向國家食品藥品監(jiān)督管理總局提出臨床試驗申請，國家食品藥品監(jiān)督管理總局受理后出具《行政許可項目繳費通知書》，注冊申請人應當按要求繳納。需進行臨床試驗審批的第三類醫(yī)療器械目錄由國家食品藥品監(jiān)督管理總局制定、調整并公布。
醫(yī)療器械產(chǎn)品注冊費繳費說明：
1.注冊申請人應當按照注冊單元提出產(chǎn)品注冊申請并按規(guī)定繳納費用，對于根據(jù)相關要求需拆分注冊單元的，被拆分出的注冊單元應當另行申報。
2.對注冊申請人按進口第二類醫(yī)療器械申請首次注冊，經(jīng)技術審評確認為第三類醫(yī)療器械的，退出注冊程序。注冊申請人按確定后的管理類別重新申請注冊，需補繳差額費用。
3.按醫(yī)療器械管理的體外診斷試劑的注冊收費適用于本實施細則。
4.注冊申請人應當在收到《行政許可項目繳費通知書》后5個工作日內按照要求繳納注冊費，未按要求繳納的，其注冊程序自行中止。
5.注冊申請受理后，申請人主動提出撤回注冊申請的，或國家食品藥品監(jiān)督管理總局依法作出不予許可決定的，已繳納的注冊費不予退回。再次提出注冊申請的，應當重新繳納費用。
6.對于注冊申請人按照第三類醫(yī)療器械產(chǎn)品申請首次注冊，經(jīng)技術審評確認為第一類、第二類醫(yī)療器械產(chǎn)品的，進口產(chǎn)品退還差額費用，境內產(chǎn)品退還全部已繳費用。